香港和內地在注冊手術控制系統醫療器械方面存在一些區別，主要包括以下幾個方面：

1. 監管：香港的醫療器械注冊由衛生署醫療器械科（MDD）負責監督，而內地則由國家藥品監督管理局（NMPA）負責。兩個監管的職責和權力有所不同，因此在注冊流程和要求上也會有所差異。

2. 注冊流程：香港的注冊流程相對簡單，通常包括提交申請、審核評估、現場檢查（如有需要）和頒發注冊證書等步驟。而內地的注冊流程則相對復雜，包括技術審評、行政審批、現場檢查等多個環節，需要提交更多的資料和經過更嚴格的審核。

3. 標準要求：香港和內地對醫療器械的標準要求也有所不同。香港采用和規范，如ISO 13485等，而內地則根據國家藥品監督管理局的要求制定標準。這些標準的差異可能會影響到產品的設計和制造過程，以及注冊時需要滿足的要求。

4. 上市許可：香港和內地的上市許可要求也有所不同。在香港，醫療器械在獲得注冊證書后即可上市銷售，而內地則需要獲得相應的上市許可證書后才能上市。此外，內地的上市許可申請需要提交更多的資料，包括產品的臨床試驗數據、安全性評估報告等。

需要注意的是，這些區別可能會隨著兩地法規的不斷更新和變化而有所調整。因此，在具體操作時，建議咨詢相關的監管或，以獲取較準確的信息和指導。