手術控制系統醫療器械注冊技術評審流程主要包括以下幾個步驟：

1. 準備資料：首先，需要準備一系列申請資料，這些資料包括醫療器械的說明書、樣品、技術報告、生產工藝等。這些資料需要詳細闡述手術控制系統醫療器械的技術特性、性能指標、安全性、有效性等內容。

2. 填寫申請表：接下來，需要填寫醫療器械注冊申請表。這個表格需要包含醫療器械的基本信息，如產品名稱、型號、規格等，還需要描述產品的適應癥、使用范圍等信息。

3. 申請提交：完成申請表和相關資料的準備后，需要將這些材料提交給國家藥品監督管理局或其建議的審評。

4. 受理審評：提交申請后，藥監部門會對申請材料進行初步審查，確認申請是否齊全、是否符合格式要求，并決定是否受理注冊申請。

5. 技術評審：如果申請受理，接下來會進行技術評審。這個階段主要是對手術控制系統醫療器械的技術特性、性能指標、安全性、有效性等進行全面評估。評審過程中，可能需要申請人提供額外的信息或澄清某些問題。

6. 審評結果：技術評審完成后，審評會出具審評結果。如果手術控制系統醫療器械滿足相關法規和標準的要求，審評結果通常會推薦批準注冊。否則，可能會要求申請人進行修改或補充資料后重新申請。

7. 許可批準和監管：如果審評結果推薦批準注冊，國家藥品監督管理局會頒發醫療器械注冊證書。獲得注冊證書后，申請人可以開始生產和銷售該手術控制系統醫療器械。同時，還需要接受相關監管部門的監管，產品的質量和安全性。

需要注意的是，手術控制系統醫療器械注冊技術評審流程可能會因具體的產品類型、技術特點以及法規政策的變化而有所不同。因此，在進行注冊申請前，建議申請人詳細了解相關的法規和指導原則，并與的咨詢或律師事務所進行咨詢和溝通。